Fakultas Ekonomi (FEUP) sampai saat ini menyelenggarakan program Pendidikan Tinggi, melalui jenjang program Diploma III (D3) dan Sarjana (S1) dengan Sistem Satuan Kredit Semester (SKS). Sejak awal berdirinya pengembangan Fakultas Ekonomi dilaksanakan sesuai Rencana Induk Pengembangan (RIP) Univesitas Pakuan, termasuk pemberdayaan Teknologi Informasi dalam rangka peningkatan kualitas pendidikan.

Program Sarjana Strata 1 (S1) memiliki 2 (dua) Program Studi, yaitu Jurusan Manajemen dan Jurusan  Akuntansi, serta 3 (tiga) program studi pada program Diploma III. yaitu Program Studi Akuntansi, Program Studi Manajemen Perpajakan dan Program Studi Manajemen Keuangan dan Perbankan. Kedua program studi  program sarjana dan kedua program studi program diploma III telah terakreditasi BAN-PT, sedangkan satu program studi Manajemen Keuangan dan Perbankan untuk saat ini dalam proses pengajuan akreditasi.

FEUP memiliki beberapa unit kegiatan yang terkait dengan penyelenggaraan proses belajar mengajar, antara lain : Pusat Studi Pembangunan Ekonomi Regional (Pusperal) yang dibentuk pada tanggal 2 November 2006, membina Jurnal Ilmiah Fakultas Ekonomi (JIMAFE) Unpak, Pendidikan dan Pelatihan Brevet Pajak A dan B, Pelatihan Program Komputer Akuntansi dengan modul Accounting World Wide (AWW) dan dengan menggunakan Microsoft Excel, Pendidikan dan Pelatihan Program Komputer Perpajakan Tax Easy, serta Bank Mini untuk bidang perbankan.

Fakultas Ekonomi didukung oleh 127 (seratus dua puluh tujuh) tenaga edukatif yang berkualifikasi Strata 2 dan beberapa Strata 3. Sesuai dengan tujuan pendidikannya, sebagian dari para tenaga edukatif tersebut juga merupakan praktisi di berbagai bidang yang relevan, seperti Manajemen, Akuntan, Auditor, Ahli Perpajakan, Ahli Komputer dan Ahli bahasa. Penyelenggaraan administrasi dilakukan oleh tenaga struktural yang dudukung oleh bagian tata usaha. Mekanisme dan prosedur administrasi diselenggarakan berdasarkan peraturan yang ditetapkan oleh Universitas.